阿法替尼在治疗的过程中，最为常见的副作用就是腹泻和皮疹。阿法替尼引起的腹泻通常出现于治疗的早期阶段，在治疗初始阶段，需要给予患者抗腹泻药物(如洛派丁胺)，建议患者一旦出现腹泻症状立即开始用药，并在腹泻后保证充足的液体摄入。在皮疹预防方面，患者应当尽量避免暴露在日光下，如果需要外出，无论季节都需要应用日光隔离措施;建议患者穿防护日光照射的衣服，戴帽子和眼镜;患者还应当避免皮肤受到强烈的刺激，如刺激性的洗涤剂等。